Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBR1LQ6UX01 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms