Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMCO3Q6UWJ1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCO3Q6UWJ1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
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