Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK5Q6P3R8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms