Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC42EP5Q6NZY7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms