Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFSP1Q6NVU6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFSP1Q6NVU6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms