Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms