Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD40Q6AI12 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms