Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG9BQ674R7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG9BQ674R7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms