Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
E4F1Q66K89 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E4F1Q66K89 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms