Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
WSCD1Q658N2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WSCD1Q658N2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms