Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USPL1Q5W0Q7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms