Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.62
CHIC1Q5VXU3 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
CHIC1Q5VXU3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms