Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGSNQ5TDP6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGSNQ5TDP6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms