Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FRMPD1Q5SYB0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
FRMPD1Q5SYB0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
FRMPD1Q5SYB0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
FRMPD1Q5SYB0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
FRMPD1Q5SYB0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
FRMPD1Q5SYB0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
FRMPD1Q5SYB0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
FRMPD1Q5SYB0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
FRMPD1Q5SYB0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FRMPD1Q5SYB0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FRMPD1Q5SYB0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
FRMPD1Q5SYB0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FRMPD1Q5SYB0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FRMPD1Q5SYB0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FRMPD1Q5SYB0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms