Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms