Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIA9

CBWD5, COBW domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBWD5Q5RIA9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBWD5Q5RIA9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CBWD5Q5RIA9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBWD5Q5RIA9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms