Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB41Q5JT25 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB41Q5JT25 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms