Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPM1JQ5JR12 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1JQ5JR12 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms