Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ODF2Q5BJF6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ODF2Q5BJF6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms