Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms