Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA3BQ502W6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms