Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCU0

Putative uncharacterized protein FLJ37770, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3ZCU0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3ZCU0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3ZCU0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms