Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TXNRD1Q16881 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TXNRD1Q16881 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TXNRD1Q16881 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TXNRD1Q16881 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TXNRD1Q16881 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TXNRD1Q16881 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TXNRD1Q16881 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TXNRD1Q16881 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TXNRD1Q16881 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TXNRD1Q16881 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TXNRD1Q16881 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TXNRD1Q16881 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TXNRD1Q16881 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TXNRD1Q16881 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TXNRD1Q16881 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
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