Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA3Q16787 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA3Q16787 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms