Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX1AQ16623 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
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