Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY1Q16526 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms