Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIP11Q15643 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms