Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RYR3Q15413 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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