Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
UBE3CQ15386 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
UBE3CQ15386 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms