Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TTF1Q15361 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTF1Q15361 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
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