Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT31Q15323 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT31Q15323 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms