Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PDK3Q15120 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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