Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PCOLCEQ15113 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
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