Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 SNX11-208ENST00000581298 563 ntTSL 56.72□□□□□ -1.336e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ZMYM1-204ENST00000417119 1825 ntTSL 26.71□□□□□ -1.346e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 WBP11-202ENST00000535328 494 ntTSL 26.43□□□□□ -1.386e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.396e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBE2E3-204ENST00000602303 654 ntTSL 56.24□□□□□ -1.416e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RUFY1-211ENST00000508609 812 ntTSL 56.24□□□□□ -1.416e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 AL359915.2-204ENST00000413531 1154 ntTSL 1 (best)6.23□□□□□ -1.416e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 LTBR-212ENST00000543542 367 ntTSL 26.18□□□□□ -1.426e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PPIH-206ENST00000461351 527 ntTSL 36.13□□□□□ -1.436e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ECH1-207ENST00000597089 343 ntTSL 26.12□□□□□ -1.436e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NEK8-204ENST00000579671 643 ntTSL 36.12□□□□□ -1.436e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RPE-215ENST00000453724 546 ntTSL 56.02□□□□□ -1.456e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.496e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 COX6C-206ENST00000520517 566 ntTSL 45.74□□□□□ -1.496e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 COX6C-207ENST00000522934 562 ntTSL 45.66□□□□□ -1.56e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ECH1-208ENST00000597205 169 ntTSL 55.38□□□□□ -1.556e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.561e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM218-211ENST00000531262 857 ntTSL 25.11□□□□□ -1.596e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ZMYM1-209ENST00000488455 3055 ntTSL 24.99□□□□□ -1.616e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.636e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TIMM9-204ENST00000555097 377 ntTSL 54.73□□□□□ -1.656e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBE2G2-210ENST00000496395 288 ntTSL 54.25□□□□□ -1.736e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.776e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TIMM9-201ENST00000216463 1075 ntTSL 33.91□□□□□ -1.786e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ZMYM1-207ENST00000475654 665 ntTSL 53.9□□□□□ -1.796e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.836e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 XPO6-219ENST00000570033 558 ntTSL 43.14□□□□□ -1.916e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TIMM9-210ENST00000557397 571 ntTSL 43.08□□□□□ -1.926e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.926e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.936e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.936e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PA2G4-205ENST00000552528 289 ntTSL 23□□□□□ -1.936e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.966e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 EHMT1-234ENST00000636526 100 ntTSL 52.74□□□□□ -1.976e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.996e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -25e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -26e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ZMYM1-202ENST00000373329 3980 ntTSL 1 (best)2.39□□□□□ -2.036e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.066e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DNAJC2-208ENST00000475065 1952 ntTSL 1 (best)2.09□□□□□ -2.085e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.126e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DNAJC2-209ENST00000475090 480 ntTSL 51.59□□□□□ -2.151e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 EHMT1-233ENST00000636472 100 ntTSL 51.58□□□□□ -2.166e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RALGDS-206ENST00000424572 926 ntTSL 57.74□□□□□ -1.172e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NADK-205ENST00000460602 974 ntTSL 225.41■■□□□ 1.665e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NADK-212ENST00000492768 859 ntTSL 325.31■■□□□ 1.645e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 WDR46-239ENST00000489905 1007 ntTSL 516.12■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 WDR46-235ENST00000473611 872 ntTSL 314.05□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 WDR46-233ENST00000461951 669 ntTSL 314.05□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PANK4-202ENST00000435556 2524 ntTSL 217.79■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CXXC1-204ENST00000586365 789 ntTSL 218.22■□□□□ 0.515e-9■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PFKFB4-214ENST00000490404 849 ntTSL 39.99□□□□□ -0.819e-14■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.712e-6■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 CNOT9-204ENST00000432877 581 ntTSL 316.29■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 CNOT9-205ENST00000433439 567 ntTSL 415.15■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 CNOT9-202ENST00000295701 1126 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 REEP4-205ENST00000519875 732 ntTSL 315.24■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 PLXND1-212ENST00000508630 563 ntTSL 26.47□□□□□ -1.376e-8■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.817e-9■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.387e-9■■■■■ 47
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EFTUD2Q15029 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.017e-9■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.077e-9■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 MLLT10-207ENST00000430455 184 ntTSL 1 (best)13.87□□□□□ -0.197e-9■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 MLLT10-214ENST00000480415 297 ntTSL 1 (best)12.4□□□□□ -0.427e-9■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 MLLT10-213ENST00000479634 165 ntTSL 1 (best)12.4□□□□□ -0.427e-9■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 MLLT10-209ENST00000462999 344 ntTSL 1 (best)12.4□□□□□ -0.427e-9■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 MLLT10-215ENST00000495130 744 ntTSL 311.64□□□□□ -0.557e-9■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 MLLT10-211ENST00000471315 319 ntTSL 311.61□□□□□ -0.557e-9■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.137e-9■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.327e-9■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 MLLT10-212ENST00000476557 490 ntTSL 1 (best)5.92□□□□□ -1.467e-9■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 DLG5-206ENST00000468332 5505 ntTSL 213.26□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 DLG5-207ENST00000475613 7246 ntTSL 513.18□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 DLG5-201ENST00000372391 7415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 47
EFTUD2Q15029 POLG-209ENST00000530715 372 ntTSL 317.68■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 POLG-207ENST00000528881 524 ntTSL 57.47□□□□□ -1.211e-7■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 RPGRIP1L-204ENST00000562588 651 ntTSL 515.52■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 RPGRIP1L-211ENST00000569716 465 ntTSL 314.57□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 NUMA1-203ENST00000366394 539 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.49□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 NUMA1-209ENST00000535111 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.81□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 NUMA1-221ENST00000541641 589 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.31□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 NUMA1-208ENST00000535087 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 410.97□□□□□ -0.655e-7■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 NUMA1-222ENST00000541719 583 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.97□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 NUMA1-210ENST00000535838 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 310.32□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 NUMA1-204ENST00000368959 583 ntAPPRIS ALT2 TSL 310.17□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 NUMA1-214ENST00000537905 598 ntTSL 39.18□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 RPGRIP1L-210ENST00000568653 2429 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 RPGRIP1L-203ENST00000562230 1107 ntTSL 1 (best)8.8□□□□□ -12e-6■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 46.9
EFTUD2Q15029 NUMA1-206ENST00000534971 878 ntTSL 25.99□□□□□ -1.455e-7■■■■■ 46.9
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