Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPHQ15003 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
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