Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNB1Q14721 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
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