Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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