Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms