Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAT1Q14517 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAT1Q14517 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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FAT1Q14517 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FAT1Q14517 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FAT1Q14517 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FAT1Q14517 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FAT1Q14517 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FAT1Q14517 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FAT1Q14517 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FAT1Q14517 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAT1Q14517 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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