Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FAM53BQ14153 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM53BQ14153 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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