Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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