Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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