Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALCAMQ13740 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
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