Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRR1Q13601 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRR1Q13601 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRR1Q13601 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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