Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC1Q13547 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC1Q13547 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC1Q13547 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HDAC1Q13547 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC1Q13547 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC1Q13547 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HDAC1Q13547 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC1Q13547 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC1Q13547 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC1Q13547 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC1Q13547 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC1Q13547 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC1Q13547 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC1Q13547 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC1Q13547 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC1Q13547 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC1Q13547 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC1Q13547 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC1Q13547 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HDAC1Q13547 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC1Q13547 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC1Q13547 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC1Q13547 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC1Q13547 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC1Q13547 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC1Q13547 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC1Q13547 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC1Q13547 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC1Q13547 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC1Q13547 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC1Q13547 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC1Q13547 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC1Q13547 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HDAC1Q13547 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HDAC1Q13547 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC1Q13547 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HDAC1Q13547 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC1Q13547 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC1Q13547 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC1Q13547 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC1Q13547 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC1Q13547 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC1Q13547 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC1Q13547 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC1Q13547 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC1Q13547 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC1Q13547 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC1Q13547 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC1Q13547 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC1Q13547 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC1Q13547 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC1Q13547 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC1Q13547 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC1Q13547 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC1Q13547 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC1Q13547 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC1Q13547 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC1Q13547 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC1Q13547 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC1Q13547 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC1Q13547 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC1Q13547 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC1Q13547 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC1Q13547 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.51■■■□□ 2
HDAC1Q13547 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
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