Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms