Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PRDM2Q13029 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
PRDM2Q13029 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
PRDM2Q13029 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms