Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A2Q12974 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms