Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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