Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 MPC1YGL080W 393 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 YGL193CYGL193C 312 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 CIR1YGR207C 786 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 MRPL6YHR147C 645 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 HRT3YLR097C 1035 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 RPS1BYML063W 768 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 YDC1YPL087W 954 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 NTH1YDR001C 2256 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 SPT23YKL020C 3249 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 EMP47YFL048C 1338 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 MCP2YLR253W 1710 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 snR63snR63 255 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 YGL088WYGL088W 366 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 SOL4YGR248W 768 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 JLP1YLL057C 1239 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 CPR3YML078W 549 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 HEK2YBL032W 1146 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 BUD7YOR299W 2241 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 IMD2YHR216W 1572 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 TAF7YMR227C 1773 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 PRP19YLL036C 1512 nt4.46□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 ATG2YNL242W 4779 nt4.46□□□□□ -1.69
SEC39Q12745 MNL1YHR204W 2391 nt4.46□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 GRS2YPR081C 1857 nt4.46□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 SLM5YCR024C 1479 nt4.46□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 TYR1YBR166C 1359 nt4.46□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 BUD13YGL174W 801 nt4.46□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 YGR219WYGR219W 342 nt4.46□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 YNK1YKL067W 462 nt4.46□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt4.46□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt4.46□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 SNF2YOR290C 5112 nt4.46□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 YFR045WYFR045W 930 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 SDT1YGL224C 843 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 APS1YLR170C 471 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 URE2YNL229C 1065 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 RGS2YOR107W 930 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 DCS2YOR173W 1062 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 SHE3YBR130C 1278 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 GDT1YBR187W 843 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 MMT1YMR177W 1533 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 HMS1YOR032C 1305 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 RAD30YDR419W 1899 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 YDL012CYDL012C 324 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 TYW3YGL050W 822 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 SRB5YGR104C 924 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 OAR1YKL055C 837 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 YMR084WYMR084W 789 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 YNL134CYNL134C 1131 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 TRK1YJL129C 3708 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 IDS2YJL146W 1410 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 TPA1YER049W 1935 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 GPB1YOR371C 2694 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 YMR1YJR110W 2067 nt4.43□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 YCR050CYCR050C 309 nt4.43□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 MRP4YHL004W 1185 nt4.43□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 YAE1YJR067C 426 nt4.43□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 YBL010CYBL010C 843 nt4.43□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 RRP40YOL142W 723 nt4.43□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 CNS1YBR155W 1158 nt4.43□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 SOF1YLL011W 1470 nt4.43□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 YEH2YLR020C 1617 nt4.43□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 YTM1YOR272W 1383 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 YDL026WYDL026W 312 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 RPP1AYDL081C 321 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 THI13YDL244W 1023 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 THI11YJR156C 1023 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 TIF34YMR146C 1044 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 SLZ1YNL196C 897 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 MDM38YOL027C 1722 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 IRC14YOR135C 342 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 SPS4YOR313C 1017 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 PBN1YCL052C 1251 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 ALG11YNL048W 1647 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 BIK1YCL029C 1323 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 TCO89YPL180W 2400 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 MSC2YDR205W 2175 nt4.41□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 YDR133CYDR133C 336 nt4.41□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 SPO20YMR017W 1194 nt4.41□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 AIM39YOL053W 1188 nt4.41□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 VPS21YOR089C 633 nt4.41□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 SRO9YCL037C 1305 nt4.41□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 GLN4YOR168W 2430 nt4.41□□□□□ -1.7
SEC39Q12745 CDC73YLR418C 1182 nt4.4□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 RAD10YML095C 633 nt4.4□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 ERD2YBL040C 660 nt4.4□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 MED7YOL135C 669 nt4.4□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 YPR071WYPR071W 636 nt4.4□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 YPR174CYPR174C 666 nt4.4□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 STP22YCL008C 1158 nt4.4□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 GWT1YJL091C 1473 nt4.4□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 MAG2YLR427W 2013 nt4.39□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 GIP4YAL031C 2283 nt4.39□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 RTC1YOL138C 4026 nt4.39□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 WSS1YHR134W 810 nt4.39□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 FMP25YLR077W 1752 nt4.39□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 IOC4YMR044W 1428 nt4.38□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 YML020WYML020W 1995 nt4.38□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 NOP58YOR310C 1536 nt4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.5 ms